Få år efter at de intelligente aber er dukket op, trues det harmoniske samliv mellem mennesker og aber af både den militante Gorilla, General Aldo og en voldelig gruppe af endnu intelligente menneskelige mutanter. Den stigende spænding mellem de to grupper eksploderer i en apokalyptisk konfrontation, der lægger hele civilisationen i ruiner. Da dødens stilhed indfinder sig og ødelæggelsernes omfang bliver synlige, er alt tilsyneladende forbi. Men der er stadig et spinkelt håb for de overlevende.