Seberg er inspireret af den sande historie om stjernen fra den franske nybølge Jean Seberg, der i de sene 60'ere kom under FBIs radar. Det gjorde hun som følge af sin støtte af borgerrettighedsbevægelsen og romantiske forhold til Hakim Jamal. I denne noir-thriller bliver Sebergs liv og karriere ødelagt af FBIs grænseoverskridende overvågning og overgreb i forsøget på at undergrave Sebergs aktivisme.