En el lugar donde se planea construir una presa en el continente de Inderia aparece un fósil en movimiento de un dinosaurio trachodon que interfiere con la construcción. El equipo científico ninja se dirige a investigar, pero un delincuente armado con una pistola se cuela en el hotel donde se encuentran ocultando su verdadera identidad. Ryu y Jinpei, que compartían habitación, luchan contra él, mientras que alguien mata al hombre con un cuchillo en la espalda. Una empleada del hotel, cree que Ryu y Jinpei son los asesinos y los huyen. Al final de su huida, llegan a un templo donde aparece un tracodón.