A 6. évad Shaun Murphy, az autizmussal élő fiatal orvos rezidens évei végére ért, és szakorvosként már önállóan végezhet műtétet, ráadásul két rezidens is érkezik hozzá. Egy drámai eset során mentora, Dr. Glassman és közvetlen felettese, Dr. Audrey Lim arra kötelezik, hogy akárcsak mindenki más, Shaun is vállaljon felelősséget a döntéseinek a következményiért.