Quando si verifica un omicidio di un ex comandante della Marina, Gibbs si imbatte in un pezzo di una vecchia bomba nucleare che era stato perso durante la Guerra Fredda, ora ritrovato da una compagnia navale privata che vuole rivenderla al mercato nero. Dato che la vittima aveva collegamenti con il padre di Tony, lo rintracciano per interrogarlo. Alla fine, con gran fastidio di Tony, Gibbs recluta DiNozzo Senior, il quale usando i propri contatti dovrà infiltrarsi in una festa privata a cui parteciperanno alcuni trafficanti d'armi.