La police de Nagano vit des heures sombres. Le dieu de la guerre s’est lancé dans un processus d’éradication d’un groupe infiltré dans la police : la société des piverts. Après avoir rencontré par hasard l’équipe policière de Kansuke Yamato (516), la découverte d’une tête humaine dans la rivière propulse Conan, Ran et Kogorô dans l’enquête. Conan repense à la description de Rhum par Haibara, et suspecte l’inspecteur Yamato, ainsi que le commissaire de Nagano, Hyōe Kuroda.